Sorry, da geht gar nix mehr. Woher soll InDesign denn noch wissen, wo welcher Font verwendet wurde?
Aber du hast ja sicher das "in Pfade umwandeln" an einer Kopie deines Dokumentes vorgenommen, so dass du noch die Originaldatei mit nicht umgewandelten Fonts hast…
P.S.: Wenn man wirklich in Pfade umwandeln [#cc0000]muss[/#cc0000], macht man das [#cc0000]nicht[/#cc0000] mit dem entsprechenden Befehl in InDesign, sondern beim PDF-Export mit der Transparenzreduzierung.