verstehe zwar nicht ganz, wie du das mit dem Ausstanzen machst, aber:
du kannst über die Zwischenablage deinen Pfad nach Illustrator schieben, dort in die Outline umwandeln und anschließend wieder zurück nach Indesign (vorher in den Voreinstellungen bei Dateihandhabung PDF ausschalten, sonst kannst du -warum auch immer - den importierten Pfad nicht mehr einzeln bearbeiten). Anschließend mit dem Direktauswahlwerkzeug beide Formen auswählen und im Pathfinder auf subtrahieren gehen.
Das wäre zumindest ein Weg ...