Nach einigem Herumspielen konnte ich das Problem auf zwei Kapitel (von 14) beschränken.
Aber hier half gar nix mehr.
Versuchte es u.a. mit einem Export des Textes im Tagged Text-Format und anschließendem Löschen des Haupttextflusses. Die Farben ließen sich jetzt löschen. Aber beim Reimport der Tagged Text-Datei stürzte ID wieder ab.
War drauf und dran, das Problem weiter - auf einzelne Seiten - einzugrenzen.
Zuvor öffnete ich das Dokument auf WIN, löschte dort die Farben und sicherte das Dokument - ohne Probleme. Öffnen auf dem MAC - Farben sind noch weg - neu abspeichern -> Absturz.
Dann waren die Prefs dran: Prefs-Ordner gesichert, ID neu gestartet, dabei Prefs gelöscht .... und nun lief alles wie am Schnürchen: Farben gelöscht, Dokument neu abgespeichert. So als ob nichts gewesen wäre.
Auf den Zusammenhang zwischen den Prefs und Textfarben, die in allen Bereichen des Dokuments vorhanden sind (Textfarbe im Zeichenformat), aber nur in zwei Kapiteln Probleme bereiten, muß man erst mal kommen. Ist mir immer noch ein Rätsel.