Moin, das kann klappen, ohne abzusehen, wie viel Nacharbeiten notwendig sein wird.
Ich kann dazu Pandoc
http://johnmacfarlane.net/pandoc/ empfehlen, das mit seiner Kommandostruktur (Win/Mac/Linux) zwar etwas gewöhnungsdürftig ist, aber neben vielen anderen die Konvertierung von LaTeX nach Incopy ermöglicht. Und von da sollte der Weg nach Indesign frei sein.
Aber wie gesagt: ohne Kenntnis der LaTeX-Dateien und ihrer Struktur, kann ich nur sagen: es kann klappen (und Nacharbeiten wird wahrscheinlich eingeplant werden müssen), aber muss nicht.